瘧疾的特效藥，目前在臨床上分為兩個大類，具體如下：1、青蒿素類：在臨床上比較多見的如青蒿琥酯、蒿甲醚等，進行靜脈、肌肉注射治療。青蒿素口服類藥物，比如可以用雙氫青蒿素哌喹片、磷酸萘酚喹片、磷酸咯萘啶，進行抗瘧治療；2、奎寧類：可以使用二鹽酸奎寧、硫酸奎寧，或者其他奎類藥物，進行抗瘧治療。在使用抗瘧藥物治療時，要注意以下幾點：1、要及時全療程進行抗瘧治療，在短時間內有效清除瘧原蟲，同時避免產生耐藥性；2、在治療過程當中，除了使用抗瘧藥物治療以外，還需要使用針對器官功能保護的藥物，改善瘧疾感染以后，引起的器官功能損害。比如使用護肝、利尿、改善呼吸循環、中樞神經系統的保護類藥物綜合使用，可以使瘧疾患者迅速好轉、康復。