瘧疾的治療，主要是以青蒿素為主的復方藥物進行治療，目前還有青蒿素的單方的針劑，或者是注射劑進行治療。青蒿素為主的單方或注射劑，主要包括青蒿琥酯注射液、蒿甲醚針劑，要連續使用七天，才能達到很好的抗瘧治療。另外后續可以采用以青蒿素為主的復方制劑，比如雙氫青蒿素哌喹、青蒿素哌喹、復方蒿甲醚片、復方青蒿琥酯片等，通過聯合的藥物治療，可以達到很好的作用，并且可以減少青蒿素產生耐藥的可能。對我國目前規定的青蒿素針劑，一定要進行住院治療。口服藥可以在門診使用，瘧疾在治療過程中，除抗瘧治療外，還要監測心臟、肝臟、腎臟、肺、腦等多臟器的功能情況，針對相應的臨床表現、相應的臟器損傷予以支持治療。需要保肝、電解質，對酸堿平衡的調節，包括顱內可能出現腦水腫的脫水治療，一定要全方位的支持治療，保證瘧疾在抗瘧治療過程中，各臟器的支持程度，使瘧疾病人能夠得到很好的治愈。