兒童羊癲瘋是由腦神經元過度放電導致的中樞神經系統功能失調，病因分為六類，分別是結構性、遺傳性、感染性、代謝性、免疫性及未知病因： 1、結構性病因：指神經影像學如頭部磁共振等檢查有可見結構性異常，并且臨床評估該結構性異常是患者癲癇發作的原因； 2、遺傳性病因：指癲癇是由已知或推測的基因突變導致。癲癇涉及的遺傳性病因較為多樣，部分病例中檢測到已知癲癇的相關基因，在部分病例中尚未檢測到明確基因突變，但推測很可能存在基因突變。相信隨著分子遺傳學的發展，越來越多癲癇的致病性基因突變將被發現； 3、感染性病因：反復癲癇發作是由感染性事件導致，如結核病、腦型瘧疾、亞急性硬化性全腦炎及巨細胞病毒感染導致的癲癇等； 4、代謝性病因：是指癲癇是由已知或推測的代謝性疾病直接導致，如氨基酸代謝缺陷病或吡哆醛依賴癥等； 5、免疫性病因：是指反復癲癇發作是由中樞神經系統的自身免疫性炎癥導致； 6、未知病因：癲癇的病因目前尚不明確。