黃體酮低說明卵巢黃體功能不足，月經周期可以分成月經期、排卵期、黃體期，來完月經后在排卵期時孕酮值比較低，排卵后在黃體生成素的作用下，卵巢的顆粒細胞發生變化，會形成黃體。黃體形成以后產生孕激素，主要是孕酮，所以黃體功能是否正常，決定孕酮即黃體酮的高低。如果黃體發育正常，孕酮不會低，如果黃體發育不足，產生孕激素的量下降，此時會出現孕酮值下降。孕酮值不足在非孕期主要造成月經紊亂，在懷孕后如果黃體酮低可能出現流產。