患者先天少一顆牙，常見有以下原因造成：1、牙齒退化：人類在不斷進化，由于食物越來越軟化，造成牙齒也出現退化，因此部分患者會出現一顆牙齒先天缺失，常發生在上頜側切牙和智齒；2、遺傳因素：造成患者先天少一顆牙齒，常發生的也是智齒；3、牙齒萌出異常：部分患者由于乳牙不能脫落，或乳恒牙交替出現異常，而引起恒牙沒有萌出，埋伏在頜骨當中，或由于頜骨發育不足，沒有足夠的間隙使牙齒萌出，也可以使某些牙齒埋伏在頜骨當中。前者常見于上頜尖牙、上頜的第二雙尖牙，后者多見于阻生齒；4、頜骨疾病：頜骨的腫瘤，如頜骨囊腫，會使得患者某個牙齒不能萌出，出現先天的口腔內少一顆牙齒的現象，常發生在下頜的第二雙尖牙，以及下頜的第三磨牙(即下頜智齒)。