腦積水手術已十分成熟，多數腦積水需行腦室-腹腔分流治療，部分病人腦積水可通過口服藥物治療。因此腦積水的后遺癥與患者手術前的基本情況、身體狀況以及患者已經具有的腦功能喪失的情況有很大關系。腦積水如果較嚴重、病程時間較長、患者的腦功能已經受到嚴重損傷，手術后患者已有的癥狀可能改善不會很大，但患者的病情不會繼續加重。即患者已有的記憶力減退、精神情緒異常、行走不穩、大小便異常等嚴重的神經功能損傷的癥狀，可不會改善或改善較差，但多數腦積水通過腦室-腹腔分流、腦室-心房分流、腦室-胸腔分流、腰大池-腹腔分流，第三腦室造瘺等手術，預后非常好。