上頜竇囊腫一般不會有不適，也不會給患者帶來不良影響，所以上頜竇囊腫通常無需特別處理，觀察即可。但上頜竇囊腫可能出現持續增大，如果充滿整個上頜竇腔，可能會有面部發脹的感覺。一般頜竇囊腫不會長到那么大，所以持續觀察即可，無需手術。如果上頜竇囊腫有充滿整個竇腔的表現，可以考慮做鼻內鏡下的上頜竇開放手術及囊腫切除手術。該手術是相對常規的術式，療效較好。上頜竇囊腫的發生，和鼻炎有一定關系，通常會合并過敏性鼻炎及慢性鼻炎的表現。建議治療過敏性鼻炎以及慢性鼻炎以緩解癥狀，對上頜竇囊腫也有間接的抑制作用。鼻炎的治療，一般可用鼻噴激素噴鼻，也可用鼻噴的抗組胺藥噴鼻，或口服白三烯受體拮抗劑。通過手術藥物治療，通常可以較好地控制和緩解鼻炎癥狀，并在一定程度上抑制頜竇囊腫。但上頜竇囊腫一般持續觀察即可，如3-5年復查鼻竇CT即可，通常不需要手術。