菌血癥的治療時間要具體情況具體分析，具體如下：1、一過性菌血癥：短時間出現，可能治療2-3天就可痊愈；2、肺膿腫或肝膿腫：體內的病灶可能定期或不定期地釋放細菌入血，此時治療時間有可能很長，1-3個星期甚至更久都有可能。在治療上不僅需要使用抗菌素將血液內細菌殺滅，還需治療膿腫，才能將菌血癥徹底解決，總療程有可能1個月甚至更久；3、耐藥菌：細菌難治如耐藥菌對常見的抗生素效果不好，可能需中間調整抗生素為更高級別的抗生素，此時病人的病程會延長。所以菌血癥個人的治療療程可能不同，一定要在專業醫生的指導下規范治療。