引起孩子頭疼的原因多種多樣，各種疾病都可能引起孩子頭疼，具體如下：1、神經系統感染：這是比較常見的。比如孩子有腦炎、腦膜炎，頭疼就是非常常見的癥狀；2、顱腦結構異常：比如孩子可能有顱內出血，或者有顱內的占位性病變，如腦腫瘤等，都可能引起孩子頭疼；3、頭部周邊臟器有疾病：比如有些孩子有青光眼、近視、中耳炎，或者牙齒有問題，口腔疾病也都可能引起孩子頭疼；4、全身性疾病：比如孩子可能會有高血壓、腎臟疾病、低血糖等，也可能導致孩子出現頭疼。此外，還有一些孩子可能會因為發熱，或者使用藥物，或者有代謝性疾病等，此時孩子的腦血管緊張、收縮、擴張等，在這個過程中也會出現頭疼；5、情緒因素：還有一些孩子可能并不是軀體疾病導致頭疼，可能會因為緊張、焦慮、壓力等情緒變化，或者緊張性改變，導致出現頭疼；6、偏頭疼：還有一些孩子可能會有原因不明的偏頭疼等病因出現頭疼。