新生兒支氣管炎的治療一般遵循新生兒肺炎治療原則，無特殊情況，建議住院治療。部分家長不愿新生兒住院，選擇口服抗生素治療，但因新生兒口服抗生素吸收較差，可導致病情的延誤甚至加重病情進展，引起新生兒呼吸困難加重甚至發生呼吸衰竭。 另外，患支氣管炎的新生兒常可出現氣道痰阻、分泌物增多，嚴重時可導致窒息、缺氧、呼吸及心跳驟停甚至危及生命。