羊水穿刺的時間，在熟練的醫生操作下，數分鐘即可完成。通常羊水穿刺的時間不長，并且也無需麻醉等操作，只需利用穿刺針進入羊膜腔，取出少量羊水即可。 如果是產前診斷的羊水穿刺，可以在超聲引導下進行穿刺，需要醫生有足夠經驗、存在穿刺指征。 如果是唐氏篩查高風險或者高齡產婦，或者曾經的孩子不健康、復發性流產的產婦，需要產前診斷，都可以進行羊水穿刺。通常孕周在16-26周，進行羊水穿刺即可。 但是最佳的時機是在22周前，這時羊水的活性、細胞更好，更易培養成功。并且羊水穿刺以后，需要注意預防感染，醫生也會與患者進行交代其它注意事項。