灰指甲是醫學上的甲真菌病，是各種真菌感染甲板或者甲下組織所導致的甲病，其病因非常明確，即真菌，包括皮膚癬菌、酵母菌和霉菌。同一病甲偶爾可以感染兩種或者兩種以上真菌，其中最多見的是皮膚癬菌感染所引起的甲病，特指甲癬。 在自然界中致病真菌很多，菌種不同，侵犯部位也不同。真菌分為淺部真菌和深部真菌，淺部真菌是指侵犯表皮、毛發、甲板的真菌引起疾病，即通常所說的癬，比如甲癬以及手癬、足癬、體癬、股癬等。深部真菌是侵犯內臟或者中樞系統的真菌，引起的真菌病為深部真菌病，部分真菌既可以侵犯內臟，也可以侵犯皮膚，如白色念珠菌。