睡覺喉嚨發癢、咳嗽的原因如下：1、外界刺激：臨床上很多病人主訴在睡覺的時候咽喉發癢，引起咳嗽。其原因是在入睡后會張口呼吸，外界刺激就會引起喉嚨發癢，出現反應性咳嗽即刺激性咳嗽，這是臨床常見的原因；2、過敏：部分病人睡覺時咳嗽，通常是夜間咳嗽，可能與過敏疾病相關。如支氣管哮喘、過敏性鼻炎病人，會出現夜間咳嗽癥狀，會影響睡眠；3、非呼吸系統疾病：如胃是食管反流病，除咳嗽外，還有燒心、反酸、噯氣等消化系統癥狀。發生上述癥狀的同時，可伴有夜間咳嗽，是胃食管反流病的特征性表現；4、咳嗽變異性哮喘：是哮喘的特殊類型，咳嗽是唯一癥狀，往往因夜間咳嗽而引起哮喘；5、睡眠呼吸暫停綜合征：表現為夜間打呼嚕時張口呼吸明顯，所以睡眠呼吸暫停征患者多數伴有咽炎，而咽炎最重要的特點就是夜間咳嗽。