生理期頭疼實際上是很多年輕女性常見疾病之一，主要是和人體內分泌環境改變以后，腦動脈或者腦部神經敏感度發生改變，神經遞質釋放發生變化而產生。可以表現為月經前開始頭疼、月經期發生頭疼，也可以發生在月經后發生頭疼，因此與其它經期綜合征聯系到一塊。上述癥狀通常有遺傳背景，在青春期比較多見，相反到中年以后由于卵巢功能減退，癥狀會得到逐步緩解。