高錳酸鉀無法治療細菌性陰道炎，通常需要使用甲硝唑或者克林霉素治療。細菌性陰道炎即細菌性陰道病，由于陰道局部優勢菌，乳酸桿菌減少，異常菌群加德納桿菌等增多所導致，出現分泌物增多、異味、外陰瘙癢等癥狀。婦科檢查可以觀察到陰道內有大量稀薄的白帶，BV檢測陽性。治療上需要針對加德納桿菌等細菌治療，比如甲硝唑或者克林霉素，可以口服也可以陰道上藥。另一方面，可以促進局部乳酸桿菌恢復，可以使用含有活菌的陰道膠囊治療。但是高錳酸鉀作為超強的氧化劑，雖然具有消毒作用，但無法治療加德納桿菌。如果發生細菌性陰道炎，應該給予口服抗生素，或者陰道使用抗生素，同時陰道使用含有活菌的陰道膠囊。單純使用高錳酸鉀溶液，通常只能緩解癥狀，無法達到治愈的效果，不可單獨使用。