服用藿香正氣水的同時，盡量避免飲酒。若在感冒期間大量飲酒，一方面容易助濕生熱，加重人體內濕熱癥狀，一方面不利于感冒痊愈。藿香正氣水藥品說明書也提到，用藥期間應注意清淡飲食、忌煙酒，避免食用辛辣、油膩、刺激食物。同時提到不良反應，主要包括胃腸道不良反應，包括惡心、嘔吐等。若在用藥同時再大量飲酒，可能加重不良反應癥狀。由于藿香正氣水是復方中成藥，藥物組成包括蒼術、陳皮、厚樸、白芷、茯苓、半夏、大腹皮、廣藿香、紫蘇葉油等，具有芳香揮發成分。從治療疾病考慮，主要是解表化濕、理氣和中，用于治療外感風寒、內傷濕滯所導致的頭痛、頭昏、脘腹脹痛、嘔吐、腹瀉，包括夏季常見的胃腸型感冒，會用藿香正氣水治療。