藿香正氣水不能治療灰指甲。藿香正氣水是中醫的經典的一個方子，它里面的成分有藿香、紫蘇、陳皮、厚樸、茯苓皮等，它具有解表、化濕和中的作用。臨床上我們用藿香正氣水來治療，夏天突然受到的風寒感冒，或者夏天暑濕的感冒，引起的頭痛、腹瀉、嘔吐、惡心等癥狀，藿香正氣水是一個非常好的中成藥。用來治療灰指甲一般沒有任何效果，因為灰指甲叫甲癬，它是由真菌感染引起侵犯到指甲的疾病，是比較頑固、比較難治的疾病。臨床上治療灰指甲，可以口服抗真菌的藥物，比如伊曲康唑、特比萘芬、氟康唑等，但是這些藥對身體會有一定影響，比如可能會影響到肝功能、腎功能，所以這些藥要在臨床醫生的指導下使用。