尿中有形物質析出而形成結晶，結晶進一步發展為結石。結石本身就是由晶體和基質構成，97%為晶體，3%為基質。根據晶體的不同，把結石分為含鈣結石、感染性結石、胱氨酸結石以及尿酸結石。結石的成分可以單一，也可以復合。而結石發生的病因非常復雜，通常把病因分為外界因素、個體因素、泌尿系統因素以及尿液成石因素。通常是在前三者的作用下，導致尿液中的成石因素增強，抑制因素減弱，尿中有形成分析出。析出物最早是晶體，逐步進展就成為了結石。尿液的酸堿度不同，其析出的晶體也不盡相同。在堿性尿當中，容易析出的結晶是磷酸鈣結晶、碳酸鈣結晶及尿酸鈣結晶。而在酸性尿當中，容易析出的結晶是尿酸結晶、膽固醇結晶、胱氨酸結晶、酪氨酸結晶、草酸鈣結晶、磺胺結晶等。所以在臨床工作中，可以根據結石的成分不同，采取堿化尿液或者酸化尿液來處理結石。