超聲檢查是診斷子宮內膜異位癥的重要檢查，B超可以看到子宮內膜異位癥、子宮腺肌癥、卵巢巧克力囊腫。腺肌癥超聲可以提示子宮肌層回聲偏強、子宮增大。卵巢異位囊腫一般超聲提示有低回聲和內可見細密光點等，診斷的特異性和敏感性在96%以上，可以提示異位囊腫的位置、大小以及性狀。但是不能單純靠超聲圖像確診，最準確的是病理結果，需要靠術中取得組織進行化驗。