慢性腎盂腎炎的典型表現主要有低熱、尿頻、尿急、尿痛，特別是夜尿次數增多、尿量增多，感染時可出現腰酸、腰疼癥狀。慢性腎盂腎炎的患者常伴有貧血癥狀，如面色不好、血色素下降、乏力、氣短、活動后心慌等。另外，患者可出現惡心、食欲不振、疲乏無力，部分人群隨著病變逐漸進展，可出現血肌酐、尿素氮增高。當逆行感染出現腎盂腎炎，尤其是患者本身有相關基礎性疾病，比如梗阻性腎病、反流性腎病等，導致腎臟間質、髓質部分的間質小管發生病變，而出現慢性感染以及腎臟結構改變，比如在B超下，腎臟表面凸凹不平，形狀有明顯異常，此時患者可伴有泌尿系統癥狀，做清潔中段尿培養可發現陽性致病菌，此時可初步判斷為慢性腎盂腎炎。