腦干血栓是否治愈取決于以下幾點：1、治療時間：如果是在超早期發生腦干血栓，尤其是在3-4.5小時之內，如果能夠到具有溶栓水平的醫院進行早期溶栓治療，比如用阿替普酶或尿激酶進行溶栓，多數患者可以將血管打通，達到完全康復的情況；2、梗塞面積大小：如果錯過超早期的溶栓治療，應根據腦干梗塞的面積大小。如果是小面積梗塞，肢體功能影響較小，僅為一側肢體輕微癱瘓，后期通過藥物治療、肢體康復，仍有較大可能恢復。如果梗塞面積較大，早期出現意識障礙，或者持續出現完全的四肢癱瘓。在此過程中會出現顱高壓，或者因為長期臥床而出現墜積性肺炎、褥瘡等，而危及患者生命；3、年齡與基礎疾病：如果部分患者年齡較大，又患有基礎疾病，雖然梗塞面積不大，但是臨床癥狀可能會較重，也會影響臨床預后，從而危及生命。