CA125在臨床上是主要用于上皮性卵巢癌檢測的一種腫瘤標志物，來源于胚胎發育期體腔上皮，在正常卵巢組織中不存在。因此，最常見于上皮性卵巢腫瘤，特別是漿液性腫瘤患者的血清中，診斷的敏感性較高，但特異性較差。黏液性卵巢腫瘤中不存在CA125，80％的卵巢上皮性腫瘤患者血清中的CA125升高，但近半數的早期病例并不升高，故不能單獨用于卵巢上皮癌的早期診斷，90%的患者血清CA125與病程進展有關，故多用于病情檢測和療效評價。 對于有特殊遺傳基因突變和卵巢癌家族史的高危人群，可考慮用血清CA125結合陰道超聲檢測，以早期發現卵巢癌。某些良性婦科疾病會引起CA125檢測結果的升高，如卵巢囊腫、卵巢化生、子宮內膜異位癥、子宮肌瘤和子宮頸炎。懷孕初期和良性疾病，如急慢性胰腺炎、良性胃腸道疾病、腎功能衰竭、自身免疫性等疾病，CA125會輕度升高；良性肝臟疾病，如肝硬化、肝炎，CA125會中度升高；各種疾病引起腹水，CA125都會急性增高。雖然CA125最高檢測值見于卵巢癌患者，但在查子宮內膜、乳腺、胃腸道和其它惡性腫瘤疾病時，CA125也可見明顯增高。