輸尿管腫瘤的治療首先取決于病理的分級、臨床分期，以及腎臟功能的情況等因素綜合進行分析，在治療上，治療的核心是手術治療。手術治療也可以分為相對較保守的手術和根治性的手術，保守的治療就是內鏡手術，內鏡手術往往是由于患者是孤獨腎或者雙側病變等，以及病理的級別比較低，而且腫瘤比較小，可以嘗試進行內鏡治療。內鏡可以以輸尿管鏡的形式進行，也可以以經皮腎鏡的形式進行。主要的方式目前是輸尿管鏡的方式更多，通過輸尿管鏡到達腫瘤部位，然后進行激光的切除，對于內鏡治療，效果可能不太好，但是又考慮保留腎單位的時候，可以考慮部分切除手術，也就是開放手術做輸尿管部分切除，然后端對端吻合。對于下端的，可以做輸尿管膀胱的再吻合，標準輸尿管腫瘤的根治性手術，過去傳統是開刀手術。手術切除的范圍包括腎臟、輸尿管、膀胱的一部分，整個患側一半的尿路都被切除，同時也盡可能地清掃周圍淋巴結組織。目前開刀的手術逐步地淡出視野。隨著腹腔鏡技術的開展，腹腔鏡下的是輸尿管癌根治術，已經逐漸地成為主流。通過腹腔鏡的方式切除患腎、輸尿管，以及部分膀胱壁，腹腔鏡手術創傷小，術后恢復快，為患者的治療帶來了好處。