現在發現的甲狀腺癌多數較早、較輕，只有甲狀腺癌出現大量、廣泛的淋巴結轉移和周圍組織器官浸潤以及遠處轉移時，才稱之為晚期甲狀腺癌。根據TNM分期，甲狀腺腫塊大小、頸部淋巴結轉移、遠處轉移，一般甲狀腺腫塊到4cm以上，同時有器官侵犯，比如氣管、喉、神經侵犯時為晚期，有遠處轉移，出現淋巴結轉移，以及肺轉移、骨轉移，稱之為甲狀腺癌晚期。 甲狀腺癌的晚期癥狀有氣管壓迫引起呼吸困難，侵犯食管引起吞咽困難，侵犯神經引起聲音嘶啞，頸部淋巴結引起轉移，壓迫深部肌肉神經時可出現頸肩部疼痛，以及上肢功能障礙等。出現皮膚損害時，可以穿破皮膚引起感染、壞死。早期只能通過胸片、CT發現肺部遠處轉移或者骨頭遠處轉移，晚期時可以引起肺部呼吸困難、骨頭疼痛以及骨折，一般晚期患者治療較困難，對病人的生存和生活質量影響較大。