泡性結膜炎認為是機體對體內的異體蛋白產生過敏反應所致。泡性結膜炎是對進入體內的異體蛋白，即不是機體本身的物質，所產生一種免疫性的反應。如患者曾感染某些病毒，比如感冒，但是病毒的毒性并不是很強，患者可能沒有任何感覺。但機體會對病毒產生抵抗作用，機體的白細胞、免疫細胞都會與病毒作戰。而上述反應稱為免疫反應，而過敏也是免疫反應過強所表現出來。泡性結膜炎表現在眼睛上可能會局部有一個皰，但局部的皰不疼，可在局部有點紅、有點充血，但是摸上去沒有壓痛。此時，稱為泡性結膜炎。一旦出現泡性結膜炎，會給患者一些抵抗免疫的藥物來抑制免疫反應，如低濃度的激素點眼，很快泡性結膜炎會好轉。此外，對容易過敏的孩子，建議少吃甜食、多鍛煉身體，也可減少泡性結膜炎的發生機會。