新冠肺炎疫苗一般指新型冠狀病毒疫苗，如果患者是慢性甲狀腺炎，病情一般比較穩定，可以注射新型冠狀病毒疫苗。如果是亞急性甲狀腺炎，血沉比較高，觸摸甲狀腺時有疼痛感，屬于炎癥活動期，此時免疫比較活躍，注射新型冠狀病毒疫苗以后，可能免疫反應比較強烈，引起不良反應，暫時不可以注射新型冠狀病毒疫苗。如果亞急性甲狀腺炎處于比較穩定的狀態，血沉正常，甲狀腺毒癥和甲狀腺功能低下趨于穩定，可能部分患者甲狀腺功能已經有一段時間完全處于正常水平，此時可以注射新型冠狀病毒疫苗。如果病情沒有穩定或者每天存在發燒癥狀，不可以注射新型冠狀病毒疫苗。血沉恢復正常以及甲狀腺功能趨于穩定時，部分患者甲狀腺功能可能恢復正常，部分患者現在已經變成甲狀腺功能減退癥，且已持續一段時間，用藥比較穩定，可以注射新型冠狀病毒疫苗。慢性甲狀腺炎中的橋本甲狀腺炎，甲狀腺功能處于比較穩定的狀態時，也可以注射新型冠狀病毒疫苗。