伽瑪刀通常在頭部與腦部腫瘤較為常用，對于較小的惡性腫瘤，通過伽瑪刀的治療，部分患者的病灶能夠消失。而對于較大的惡性腫瘤，在伽瑪刀治療時，可能不一定能夠使腫瘤完全消失，通常只能夠使腫瘤縮小。但是對于良性的腫瘤，如垂體瘤、聽神經瘤等，在進行伽瑪刀治療時，腫瘤同樣不一定能夠完全消失。良性腫瘤的治療，主要目的是腫瘤能夠保持穩定且不再增大。如果在治療效果好的情況下，隨訪多年也會發現部分病灶縮小，從而減少良性腫瘤的進一步進展，也是治療的重要方式。腦部腫瘤目前除伽瑪刀，通常還可以使用更為靈活且運用較多的為射波刀，射波刀與伽瑪刀在腦部的使用上適應證相似，只是射波刀應用于全身的體部腫瘤的治療更為廣泛。