卵巢囊腫可能會自行消失。卵巢囊腫根據性質不同，有不同的種類，可以自行消失的卵巢囊腫一般指的是卵巢生理囊腫，即在女性月經后半期，排卵后發生的卵巢黃體囊腫。卵巢黃體囊腫是一種生理性的囊腫，在排卵以后形成，有時在超聲檢查時，無意中發現附件區有一個無回聲區。平時一般沒有明顯癥狀，只是在常規的超聲檢查時偶然發現。一般可以經過1-2個月經周期的觀察，在做B超復查的時候，最好要在月經剛結束時，一般不會有卵巢生理性囊腫。在復查時，往往囊腫就會自行縮小，或者是自行消失，生理囊腫不需要給予處理。而其他性質的卵巢囊腫就很難自行消失，包括卵巢炎性囊腫或者卵巢的子宮內膜異位囊腫。卵巢炎性囊腫一般可以通過消炎治療，來幫助囊腫吸收。但是如果是反復不能治愈的囊腫，炎性囊腫或膿腫，需要進行手術治療，而子宮內膜異位囊腫大多數需要進行手術治療。