肝膿腫導致患者死亡是因為感染沒有得到有效的控制，使患者出現感染性休克、敗血癥，導致全身多器官功能衰竭，最后造成死亡。此類患者存在感染的癥狀，血液中的細菌會隨著血液循環到達肝臟，而后可能在肝臟的某一個部位定植。因為患者的抵抗力也相對比較低，沒有有效的將細菌清除，使細菌在肝臟部位大量的增殖，形成炎癥。而炎癥與機體抵抗力形成對抗，如果抵抗力得到有效的加強，在醫生或藥物的幫助下，可以消除炎癥。如果抵抗力沒有得到有效的加強，沒有能力抵抗炎癥，炎癥則可以擴散，如果雙方僵持不下，細菌可能僅局限在肝臟，形成膿腫。而膿腫會出現大量膿液，而膿液是細菌感染后的大量分泌壞死的液體。如果膿腫一旦破潰或炎癥擴散，患者則會出現心率增快、血壓下降，體溫上升到39℃甚至40℃，誘發患者的心臟、肝臟、腎臟功能衰竭，可能危及患者生命，甚至導致患者死亡。