宮頸癌的主要病因是人乳頭狀瘤病毒感染，且主要是高危型的人乳頭狀瘤病毒。具體病因可能與患者擁有多個性伴侶、女性多產、早婚等相關，具體情況還待研究。但HPV目前被認為宮頸癌發生的重要的原因之一，因此患者在進行宮頸癌TCT檢查時，通常合并HPV的篩查試驗，如果連續2年上述試驗結果都為正常，患者可以間隔2-3年再進行檢查。在臨床上也發現HPV陰性的患者檢查后，發現患有宮頸癌，但是HPV感染相關的宮頸癌占99%以上，所以TCT的檢查不可替代，不能只進行HpV檢查，而不進行TCT檢查。因為在臨床工作中出現TCT檢查顯示是CINⅢ級，即宮頸癌前病變Ⅲ級，但是HPV反復檢查都為陰性的患者。因此導致患者發生宮頸癌可能有其他的原因，除HPV16以外，也可能還有目前還沒有發現的其他的感染，或者是其他的病因所致。