陰莖根部三角區右側疼痛，可能是因為前列腺炎，或者是右側精索靜脈曲張、右側陰莖根部毛囊發炎等原因所致，出現這種情況，要到醫院的泌尿外科或者男科就診，可以明確病因。1、前列腺炎：除陰莖根部疼痛外，還會有尿頻、尿急、排尿灼熱感，排尿、排便后尿道口有分泌液流出，也可能會出現射精疼痛等，這種情況做前列腺液檢查可以診斷清楚；2、右側精索靜脈曲張：這種疼痛主要表現在站立時、大量運動后加重，平臥位后會緩解，做陰囊彩超可以評估清楚，曲張程度重建議手術治療；3、右側陰莖根部毛囊發炎：如果發現陰莖根部毛囊發炎，局部會有發紅、腫脹、疼痛等癥狀，此時如果炎癥比較輕，建議口服廣譜抗菌素，如果炎癥比較重，已經形成化膿性改變，就要進行手術切除。