如果懷疑寶寶有手足口病，需要及時就醫，醫生根據臨床癥狀即可判斷。比如寶寶發燒第1天有咽痛要及時就醫，醫生在檢查時候發現咽峽有紅點或者皰疹，發燒第3天后發現手腳、膝蓋與肛周有皰疹，可以確診是手足口病。 手足口病早期與皰疹性咽峽炎沒辦法完全區別，但手足口病與皰疹性咽峽炎治療卻相同，因為上述兩種疾病致病病毒相同。所以不管是何種疾病都可以及時治療、及時隔離。手足口病也可以通過檢測柯薩奇16型與EV71型病毒抗體，可以查出病原體。但目前為止檢驗室提供檢測只有上述兩種類型，即柯薩奇16型與EV71型。