甲鈷胺不建議長期服用，有一定副作用，它是內源性維生素B12，即輔酶B12，是臨床中人體內唯一具有金屬元素的B12。由于輔酶存在，使維生素B12更易進入神經組織，可以促進神經傳遞性，同時甲鈷胺能夠促進卵磷脂合成和神經髓鞘形成。甲鈷胺在臨床上廣泛用于各種神經炎性病變，如糖尿病周圍神經病變以及青光眼引起的視神經萎縮，同時甲鈷胺可以用于治療巨幼細胞性貧血等。但長期口服甲鈷胺可以出現過敏反應，患者會出現皮疹、面色紅腫等。部分患者口服甲鈷胺后，會出現食欲不振、惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀，少數患者會出現周圍性水腫或者低血壓性暈厥等，所以甲鈷胺不建議長期口服。嚴重時可出現低血鉀、高尿酸血癥等癥狀，誘發痛風患者的痛風發作。對于長期接觸汞的患者，不建議口服甲鈷胺，因為甲鈷胺會與汞產生化學反應。