患者存在深褐色尿液通常提示發生疾病，具體分析如下：1、泌尿系統出血性病變：尿液顏色發暗、發黑，有時表現為紅褐色，若發生此類情況，通常為泌尿系統出血性病變，如尿路上皮腫瘤，包括腎盂癌、輸尿管癌、膀胱癌等發生出血，導致尿液顏色變深、變紅，長時間存在出血則會變為褐色；2、肝膽疾病：當膽道系統或肝臟出現疾病，血液中的膽紅素數水平過量增高，導致尿液中排出的膽紅素增多，從而導致尿液呈黃褐色。