安全期發生沒有采取安全、可靠避孕措施的性行為，有可能發生意外妊娠。女性即使在安全期，受到外界壓力刺激、情緒影響或在性生活過程中內分泌水平刺激，均易出現意外排卵。發生意外妊娠，需終止妊娠時會給女性身體帶來較多傷害，如增加出血、感染風險，由于手術操作而導致器官損傷等。因此建議盡量避免應用安全期方法進行避孕，因為安全期避孕方法并不安全。即使為安全期，也應采取更為安全、可靠的避孕措施，如使用避孕工具、口服短效避孕藥等。