對于肛乳頭瘤如果不進行手術，癥狀可以緩解但較難自行消退。肛乳頭瘤為實質性腫瘤，可能會導致出血或存在惡變可能。肛乳頭瘤大多為良性，但如果反復受大便刺激，未緩解炎癥狀態仍有惡變可能。良性肛乳頭瘤也易造成局部出血甚至感染，形成肛裂、肛漏等肛周疾病，所以出現肛乳頭瘤應積極治療或手術切除。肛乳頭主要作用為分泌黏液、保持肛周濕潤以及排便潤滑，為正常直腸、肛管特殊解剖結構。由于肛乳頭的特殊位置，易造成大便在此存儲并損傷肛乳頭，尤其長期腹瀉或便秘易造成損傷。出現肛乳頭損傷時，反復炎癥刺激可導致肛乳頭瘤。