臨床上根據兒童骨腫瘤的性質不同，生長部位存在一定的差異。通常兒童的良性骨腫瘤容易生長在四肢的長骨，如下肢的股骨、上肢的肱骨等骨骼，而兒童生長的惡性骨腫瘤，以骨肉瘤較多見，多發生于下肢的股骨。對于良性和惡性的骨腫瘤，其原發腫瘤發生在長骨偏多，發生在脊柱、骨盆等部位偏少。對于繼發性骨腫瘤，兒童容易發生在腰椎、胸椎、骨盆等脊柱骨，四肢骨的發生率較低。繼發性骨腫瘤多為癌癥通過血行途徑形成的惡性腫瘤，其分期偏晚，并且脊柱骨發生的腫瘤容易導致骨折等嚴重的風險。