男性小便發黃的原因，常見有以下幾種：一、生理性原因：由于飲水量過少而導致的生理性尿液過度發黃，其原因是進水量過少，排出量逐步減少，導致尿液過度濃縮，自然排便后，會出現深黃色的尿液。如果沒有特別癥狀，通過多飲水、多排尿，以增加體液循環，尿液顏色自然可以逐步清亮。二、病理性原因：1、泌尿系統感染：如出現明顯的尿頻、尿急、尿痛，甚至是血尿，需懷疑是否存在泌尿系統感染。患者可以到醫院進行B超檢查，以及尿常規，如果提示尿中存在明顯白細胞，泌尿系感染的診斷即可成立，通過應用廣譜抗生素進行治療，大部分患者可以治愈。2、其他原因：包括泌尿系統腫瘤，或泌尿系統結石等，患者會出現單側腰部的劇烈疼痛，或無痛性肉眼血尿，顏色多數呈洗肉水樣，可以通過做B超或CT等檢查，明確診斷后進行對應治療。