新型冠狀病毒感染是由新型冠狀病毒引起的一類急性的呼吸道傳染病，在中醫屬于疫病的范疇，在中醫而言，對于疫病一般會采取辨證施治的方法。目前沒有這樣的臨床研究或者基礎研究，來證明連花清瘟膠囊能夠預防新型冠狀病毒。在新型冠狀病毒感染診療方案中，就推薦在醫學觀察期具有發熱和乏力的患者應用連花清瘟膠囊進行治療。中醫認為，具有發熱的患者可以應用清熱解毒的治療，連花清瘟膠囊就是有這樣的作用的中成藥。