由于血前列腺屏障的存在，并非所有的抗生素能進入到前列腺組織內，達到有效的治療濃度。所以對于前列腺的抗生素選擇，通常是要求其為脂溶性，能夠透過前列腺包膜、血清蛋白結合少、抗菌譜廣、弱堿性。但是急性、慢性前列腺炎的抗生素選擇有所差異，具體如下：1、急性前列腺炎：可以應用幾乎所有的抗生素，盡管有些非脂溶性的抗生素需要靜脈點滴，但研究發現其在前列腺組織內也能達到有效的藥物濃度。此時考慮可能是在急性炎癥時，這種血前列腺屏障被打破，所以藥物能夠進入。因此一般是靜點加口服抗生素，處理急性前列腺炎；2、慢性前列腺炎：一般是要求脂溶性抗生素，首先是磺胺類的藥物，其被認為在前列腺組織內藥物濃度比較高，但是由于抗菌譜比較窄、副作用比較大，所以目前在臨床上并不太常用。臨床上推薦的一線用藥是喹諾酮類抗生素，其能夠進入到前列腺組織內，而且抗菌譜也比較廣，所以成為前列腺炎治療的一線用藥。還有像阿奇霉素、多西環素類藥物，也可以進入到前列腺組織里進行應用。目前研究也顯示，新一代的大環內酯類抗生素在前列腺中的濃度要比新一代的喹諾酮類抗生素濃度還要高，這可能為前列腺炎的抗生素選擇帶來新的方向。