咽喉黏膜充血要看發病時間長短、癥狀嚴重程度及導致的原因，進行有針對性的治療。病程在1周以內，通常與病毒感染導致急性咽炎有關。咽喉黏膜充血、腫脹、咽痛，并伴隨發燒，但癥狀較輕時，發燒通常不會超過3天，病情會逐漸緩解和恢復，1周左右自愈，不需要藥物治療。發燒及咽痛超過3天且癥狀持續不緩解，考慮細菌感染的可能性，必要時要使用抗生素治療才會有效治愈。另外，咽喉粘膜充血如果是一種慢性充血，常與反流性咽喉炎有關，必要時要使用抑制胃酸的藥物治療才能取得較好的療效。