如何確定患者的口腔內是否感染了HPV病毒，要根據患者的疾病歷史、患者口腔以及全身臨床癥狀，加以輔助檢查以便診斷標準，才能確定患者的口腔內是否一定感染了HPV病毒。一般口腔內感染HPV病毒患者，有不潔的性生活歷史，特別是有口腔的接觸，可能會導致口腔內感染HPV。最典型的診斷標準是臨床表現，如果口腔黏膜出現一些丘疹、皰疹或者增生，特別是一種乳頭狀增生，可能呈菜花狀或融合起來的增生組織，基本上考慮是口腔內感染HPV。再結合相關的病理檢查以及實驗室檢查，就可以診斷是否感染了HPV。