主動脈縮窄手術的主要后遺癥是手術臨近區域的動脈血管狹窄或者閉塞。主動脈弓發出了非常重要的三根血管，這三根血管是為頭、胳膊供血的，叫頭臂動脈、鎖骨下動脈和頸總動脈。這幾根血管又發出不同的分支，為胳膊、椎動脈、顱內頸內動脈、頸外動脈等供血。在主動脈弓存在狹窄、縮短的基礎疾病時，可能會累及到這幾根血管。此外，手術過程中也可能涉及到這些血管。部分主動脈縮窄患者本身除主動脈地方縮窄，其它大血管也可能存在同樣的問題。這些血管若狹窄或閉塞，可導致其對應供血組織器官缺血，如胳膊供血不夠，可能從腦部為胳膊供血，稱為盜血或者竊血。頭頸動脈若狹窄、閉塞，會出現腦供血不足，甚至腦梗死。