克羅恩病本身是炎癥性腸病，是一種自身免疫病，自身免疫力攻擊了自身胃腸道，從嘴巴到肛門整個消化道全程都可以受累。主要表現為潰瘍，而且這種潰瘍跳躍式分布，病變不連續，病變和病變之間隔著一段，在局部有鋪路石樣改變以及增殖，而且是特別深的潰瘍。 還會出現穿孔，這種穿孔和游離穿孔不一樣，游離穿孔是大家平時看到的胃穿孔十二指腸穿孔，是慢性穿孔，病人沒有突然出現劇烈腹痛，是機體中腸穿孔以后在局部形成瘺管，可以在兩個部位之間形成交通。克羅恩病治療和其它自身免疫病狼瘡一樣，涉及到用激素和其它免疫抑制劑，該疾病不可治愈。