雙側腎臟囊腫吃什么藥物最好，需要根據實際情況進行判斷，具體如下：1、良性囊腫：如果囊腫只是良性、單發性囊腫，在直徑＜5cm時不需要特殊的治療，也不需要服用藥物，只需要在日常生活中動態觀察，定期做泌尿系統彩超或者腎臟CT，觀察囊腫增大的情況；2、囊腫較大：如果直徑達到5cm，需要在B超引導下做穿刺抽液處理，這時可以服用止血藥物和消炎類藥物，但是需根據情況服用；3、腎臟老化：如果囊腫隨著年齡增長逐步增大，有可能是腎臟老化的表現，所以不需要服用任何藥物。腎臟老化而出現的腎臟囊腫，任何藥物都無法阻4、惡性囊腫：如果雙側腎臟囊腫是惡性病變，需要進行手術處理，服用口服藥物解決不了問題；5、多囊腎：如果雙腎囊腫是多囊腎造成，在雙側腎臟囊腫出現高血壓或者肌酐升高時，需要服用降壓藥物以及排除毒素的藥物進行治療。降壓藥物首選鈣離子拮抗劑，如果出現肌酐升高，要選用尿毒清、腎衰寧或者海昆腎喜等排毒藥物，進行降低肌酐的治療，如果出現貧血，需要服用鐵劑或者促紅細胞生成素、羅沙司他。