頭痛伴有低燒，可由多種疾病導致，可能互為因果，患者可由于頭痛伴有低燒，也可能是低燒引發頭痛，需要醫生進行詳細檢查，常見原因如下：1、全身系統性疾病：需要查看是否存在全身系統性感染，比如感冒、著涼、發熱，在發熱的情況下，患者可出現頭痛；2、顱內器質性疾病：需排除是否為顱內器質性疾病導致的頭疼和低燒，例如顱內炎癥性疾病，可能會出現頭痛伴有低燒，患者常表現為惡心、嘔吐，查體時發現頸部僵硬，下巴無法碰到胸部，即腦膜刺激征陽性或克尼格征陽性、布魯津斯基征陽性。此外，當患者出現蛛網膜下腔出血引起頭痛時，血液吸收后會引起低燒。