頭部CT可檢出鼻咽癌，并能了解鼻咽癌局部癌灶情況，如是否侵犯鄰近的結構、咽旁間隙。還可以了解咽喉間隙及頸部是否有淋巴結轉移，顱底的骨質是否破壞，顱內的腦實質是否受侵，因此頭顱CT可檢測出鼻咽癌。 對于非常早期的鼻咽癌，癌灶非常小，CT檢查可能無法檢出。如果患者有明顯的回縮性涕血、頭痛、復視、聽力下降等癥狀，建議患者進行鼻咽鏡檢查，檢測鼻咽部的病理情況是診斷鼻咽癌的金標準。如果鼻咽鏡確診是鼻咽癌，通常建議患者進行磁共振檢查，鼻咽磁共振檢查是目前臨床進行放療計劃的一個最重要的指導。