腸絞疼臨床上稱腸絞痛，嬰兒腸絞痛的原因比較復雜，確切的病因現在并不是很清楚，目前研究與以下因素有關：1、遺傳因素：大多數疾病都和遺傳因素都有關系，也很難改變；2、飲食因素：可能是母乳喂養的嬰兒，有乳糖不耐受。是嬰兒腸絞痛的常見原因，由于乳糖，不能夠有效消化和吸收，導致腸道痙攣，出現了腸絞痛的情況。所以有的嬰兒換成免乳糖奶以后，夜間哭鬧情況就能有所緩解；3、過敏因素：尤其是對于人工喂養的嬰兒，人工喂養的嬰兒對牛奶過敏，換成深度水解蛋白的奶粉，或者換成氨基酸奶粉，病情就會好轉；4、菌群紊亂：嬰兒腸絞痛與嬰兒腸道菌群紊亂有很大的關系，與腸道正常菌群沒有建立或者建立不完善有很大的關系。補充微生態制劑以后，腸絞痛能有所緩解。以上都是與嬰兒腸絞痛密切相關的發病因素，有精神、心理因素、遺傳因素，所以嬰兒腸絞痛，確切的發病因素不清楚，但是與以上因素有關系。