患者出現牙根短的原因和治療方法具體如下：1、內源性因素：患者在形成牙根和牙冠時，胚胎期牙胚導致牙根較短，與遺傳因素有密切關聯。可進行牙齒修復和根管治療，并且進行樁冠修復，改善和解決牙根短的問題；2、外源性因素：主要是創傷、炎癥導致牙根和牙槽骨吸收，造成患者牙根短。應及時進行根管治療，如果牙根太短造成大量牙槽骨吸收，應及時拔除，徹底消除炎癥，再進行鑲牙的修復。