潛伏期是人感染某種病原體，如病毒或細菌，從病毒和細菌進入體內到產生臨床癥狀，如出現發燒、渾身不適的表現的時間，統稱為潛伏期。手足口病的潛伏期是指手足口病的病毒，如EV71病毒、柯薩奇病毒、埃可病毒等引起手足口病的病毒進入體內，到會出現發熱、口腔的皰疹、潰瘍，或者出現手足部位的皮疹等表現的時間，一般2-3天，平均1周左右時間，在潛伏期內患者沒有任何的臨床表現，但是存在傳染性。